Létezik önálló kórképként jelentkező fejfájás, de olyan is, amely más betegség, például anyagcserezavar, pajzsmirigybetegség, vashiány, vérszegénység, emésztőrendszeri probléma kialakulására utal. Fejfájást okozhat az agydaganat is, melynek tünetei alapján meg lehet határozni az elváltozás helyét.