Még a római pápa is áldását adta a köldökzsinórvérből származó őssejtek használatához, illetve az ezzel végzett kísérletekhez, tehát etikai aggályok ebben az esetben nem merülhetnek fel. A valódi embrionális őssejtek, tehát a legjobb őssejtek kutatási célú használata viszont tilos, mivel ezekhez embriókat kell létrehozni. A legfrissebb japán kutatások azonban köldökzsinórvérből származó őssejtekből tudtak létrehozni eredeti őssejteket, sőt egy másik kutatócsoport arra az eredményre jutott, hogy a köldökzsinórt alkotó Wharton-kocsonya ideálisabb őssejtforrás, mint a köldökzsinórvér.